VQG Cúc Phương đã hợp tác với Tổ chức Bảo tồn rùa Indo - Myanmar trong công tác cứu hộ, bảo tồn các loài rùa nước ngọt và rùa cạn của Việt Nam.
Nghiên cứu khoa học ở vườn quốc gia là nhiệm vụ quan trọng để phục vụ công tác BTTN. Là vườn quốc gia được thành lập sớm nhất, VQG Cúc Phương đã có bề dày trong công tác nghiên cứu khoa học và HTQT. Vườn đã hợp tác với nhiều nhà khoa học trên thế giới và các tổ chức quốc tế như: Tổ chức FAO, UNDP, WWF, FFI, Vườn thú Leipizg thuộc Cộng hòa Liên bang Đức, Trường đại học Illinoise, bang Chicago - Hoa Kỳ, Vườn thú Newquay - Vương quốc Anh, Quỹ Waterloo thuộc Vương quốc Anh, Trung tâm Bảo tồn động vật hoang dã tại Việt Nam (SVW), Tổ chức Bảo tồn Indo-Mynamar (IMC), Tổ chức bảo tồn rùa châu Á (ATP)...Những thế mạnh đó đã giúp Vườn đạt được nhiều kết quả đáng kể trong công tác nghiên cứu khoa học.