Chương trình nghiên cứu sinh thái và bảo tồn Rùa được hợp tác giữa Vườn Quốc Gia Cúc Phương với tổ chức Bảo tồn động thực vật hoang dã thế giới (FFI). Mục tiêu của Chương trình nhằm cứu hộ và bảo tồn các loài Rùa cạn và rùa nước ngọt của Việt Nam đang bị săn bắt, buôn bán và do mất môi trường sống. Đồng thời tiến hành chương trình nâng cao nhận thức cho cộng đồng dân cư đối với công cuộc bảo tồn rùa Việt Nam.

Chương trình Bảo tồn Thú ăn thịt và Tê tê (CPCP) là một hoạt động phối kết hợp giữa Vườn quốc gia Cúc Phương và Trung tâm Nghiên cứu và Bảo tồn Động vật hoang dã  được thế giới ghi nhận là đơn vị đi đầu trong công tác nghiên cứu và chăm sóc tê tê trong môi trường nuôi nhốt

Ngày 19 tháng 10 năm 2012, Chương trình bảo tồn rùa Cúc Phương đã tiếp nhận hai cá thể của loài Rùa sa nhân (Cuora mouhotii) và một cá thể của loài Rùa hộp trán vàng miền Bắc (Cuora galbinifrons) từ Hạt kiểm lâm Hương Sơn - Chi cục kiểm lâm Hà Tĩnh. Đây là hai loài rùa quý hiếm của Việt Nam. Đặc biệt là loài Rùa hộp trán vàng miền Bắc là loài có nguy cơ bị tuyệt chủng (EN) trong sách đỏ Việt Nam và được liệt kê ở mục IIB của Nghị định số 32/2006/NĐ-CP về quản lý thực vật, động vật rừng nguy cấp, quý, hiếm.

Cả ba cá thể rùa trên đều trong tình trạng sụt cân, phản ứng yếu. Riêng cá thể Rùa hộp trán vàng miền Bắc có một chân sau bị hoại tử (có thể do bị mắc bẫy). Các nhân viên của Chương trình bảo tồn rùa đang khẩn trương chữa trị và chăm sóc đặc biệt với các cá thể rùa mới tiếp nhận này.